Tomo-chan Is a Girl! es una serie anime basada en el manga homónimo de Fumita Yanagida. La trama tiene como protagonistas a Tomo y Jun, dos amigos de la infancia que pasan el día juntos. Tomo siempre ha ocultado sus sentimientos hacia Jun, pero cuando empiezan el instituto decide confesaler que está enamorada de él.
El problema es que Jun la ve como un hermano y no es capaz de sentir nada más por ella que un fuerte amor fraternal. Tomo no va a rendirse y está decidida a hacer todo lo que esté en su mano para conquistar a Jun.