Makoto Shinkai es también el director de la película de animación japonesa más taquillera de la historia, Kimi no Na Wa (Your name).
La película se basa en un cómic escrito por el mismo director, Makoto Shinkai. Está dividido en dos volúmenes de cinco y seis capítulos respectivamente, pero algunos se excluyeron en la adaptación, de forma que cuatro de los seis capítulos de la segunda parte no se han animado.
El título Cinco centímetros por segundo viene de la velocidad a la cual los pétalos dela flor del cerezo caen del árbol. Estos pétalos son una representación metafórica del paso del tiempo en los seres humanos.
En la primera parte, Akari y Takaki encuentran un gato llamado Chobi y hablan de otro llamado Mimi. Estos nombres hacen referencia a dos personajes que aparecen en un trabajo anterior del director Makoto Shinkai, en el corto Kanojo to kanojo no neko (Ella y su gato).