En 2018 Isaki Lacuesta ha obtenido por esta película la Concha de Oro a Mejor Película en el Festival de San Sebastián. Ya había sido galardonado con la Concha de Oro por su filme Los pasos Dobles (2011). Aparte, en este festival Lacuesta había ganado el Premio FIPRESCI por Los condenados (2009).
Entre dos aguas es la continuación de la ópera prima de Isaki Lacuesta, La leyenda del tiempo, que se estrenó en 2006. La película cuenta con los mismos personajes, los hermanos Isra y Cheíto.
Isaki Lacuesta vuelve a co-escribir el guión de esta película con su colaboradora habitual Isa Campo, guionista de otros filmes de Lacuesta como La propera pell (2016), Los pasos Dobles (2011) o Los condenados (2009).
La banda sonora del filme la componen Raül Fernández Miró y Kiko Veneno.