En el año 0079, la rebelión del Principado de Zeon contra la Federación Terrestre desata una guerra espacial devastadora. Tras meses de combate, la Federación toma una base estratégica de Zeon en Europa del Este, lo que lleva a Zeon a enviar un batallón mixto de élite para recuperarla y cambiar el rumbo del conflicto.
En un Tokio futurista, un joven hacker huérfano se ve envuelto en la investigación de un asesinato ligado al narcotráfico, descubriendo las oscuras fallas ocultas bajo la utópica fachada de la ciudad.