Safe Harbour sigue a cinco australianos que salen a navegar y durante su travesía se encuentran con un barco pesquero averiado lleno de refugiados, algunos gravemente enfermos. Los australianos tienen que decidir si ayudarles o no, para ello deciden someterlo a votación y lo aprueban, a pesar de que no todos están de acuerdo en hacerlo.
Años después de los sucesos, uno de los australianos se reencuentra con una de las personas que estaba a bordo del barco pesquero y cambia su vida por completo, metiéndole de lleno en situaciones que pueden poner su vida en peligro. Con el encuentro una investigación policial da comienzo para estudiar el incidente desde el principio y resolver la muerte de 7 personas.