Los hombres de negro: la serie esta basada en la popular película de 1997 cuyo nombre títula a la ficción. Jay, Kay y Ele vuelven comos los hombres y mujeres de negro, una organización de alto secreto creada para combatir la inmigración extraterrerte y evitar que la gente sepa que estos inquilinos han llegado a la tierra.
El Agente K, que recupera la memoria mediente un deneuralizador, sigue siendo pareja del Agente J. El Agente L se trasladó al laborario dentro de la sede de Los Hombres de Negro, sede que no se encuentra bajo la construcción de la batería del túnes de Brooklyn, sino que ahora está instalado en lo que parece ser una zona en desuso del aeropuerto de La Guardia.
La tierra, representada por el MIB, entra en una Alianza Galáctica de paz, para mantener su neutralidad y ofrecer sus territorios para entablar conversaciones de paz. La misión del MIB es proteger a la Tierra de cualquier daño de origen extraterreste y el mantenimiento de la paz en el planeta y en la galaxia.