A principios del siglo XIX. Vuelve a Edo, después de tres años de estudio en Nagasaki, el joven doctor Noboru Yasumoto está decidido a hacer una carrera brillante. Sueña con una cita en el shogunato hospital. Su conocimiento de la medicina occidental y de sus orígenes está destinado a las más altas esferas médicas. Sin embargo, en su primera tarea le envían a un barrio muy pobre de Tokio.
En Yokohama, un malhechor secuestra a un niño, al que toma por el hijo de un industrial japonés. En realidad se trata del hijo de su chófer. Se encarga al comisario Tokura que investigue el asunto.
En 1860, Sanjuro, un 'ronin' -es decir, un samurái sin amo-, vaga por los caminos hasta llegar a un pequeño pueblo. Sanjuro es un diestro guerrero que en otro tiempo sirvió a la realeza y que ahora, a pesar de gozar de la ventaja de ser libre, apenas tiene recursos para sobrevivir. Sanjuro descubre en el pueblo hay dos bandas de delincuentes ...