Después de la caída de Kong, la Doctora Lorna Jenkins logra clonarlo mediante ingeniería genética y antiguos artefactos de su isla. Pero cuando un arqueólogo oportunista descubre su creación y ella se niega a compartir el crédito, se ve obligada a huir con el joven Kong para protegerlo de quienes quieren usarlo con fines oscuros. Juntos se refugian en la isla, donde intentan vivir en paz mientras enfrentan nuevas amenazas.