Fox Mulder ha sido abducido. Tras estar tantos años investigando lo referente al campo paranormal; la interacción entre este ámbito y el doctor ya es un hecho. Mientras tanto, Scully sigue a la búsqueda de su desaparecido amigo pero, esta vez, no lo hará sola.
Le acompañarán el líder de una fuerza especial del FBI, John Doggett, y la especialista en rituales criminales, Mónica Reyes. Scully deberá lidiar frente a todas estas complicaciones con los añadidos del inminente nacimiento de su bebé y una amenaza oculta que espera su momento para atacar.
21 episodios
Cadena original FOX
Emitida desde: 5 de noviembre de 2000
Ver reparto completo de la temporada 8
Una nave extraterrestre se posa sobre el desierto de Arizona y, tras tomar tierra, se hace invisible. Mientras tanto, Doggett se enfrenta a Mulder y lo obliga a que suelte a Gibson Praise. Mulder obedece, pero cuando Doggett le ordena al agente que se entregue en forma pacífica, éste empieza a caminar hacia el borde del acantilado y, antes de que Doggett pueda reaccionar, Mulder cae al vacío.
Los agentes Scully y Doggett deberán investigar unas extrañas mordeduras que sufren los habitantes de un pequeño pueblo de Ohio.
En 1990 un niño desapareción del patio de su colegio. Diez años después parece haber regresado a casa por fin, pero el problema es que está exactamente igual que el día que desapareció: no ha crecido.
Doggett y Scully investigan un extraño accidente en el metro de Boston. Scully, temerosa por su embarazo, decide quedarse fuera para reunir información, mientras Doggett baja a los túneles con tres especialistas. Una vez abajo encuentran varios cadáveres y parece ser que el asesino es un extraño organismo.
El FBI no acepta la petición de Mulder de ser reasignado a los Expedientes X, e incluso sugieren que tal vez debería dejar la agencia. Por otro lado, un asesinato en la Casa Blanca hace que Mulder comience a investigar.
Mulder y Scully están pasando una agradable velada cuando ella sufre un desmayo. En el hospital, el agente no podrá acompañar a su amiga porque sólo pueden pasar los familiares, pero se encontrará con Doggett, que está preocupado por su compañera.
Doggett es enviado a una plataforma petrolera para investigar la muerte de un trabajador mexicano, pero Mulder cree que lo que ocurrió fue culpa de la exposición al oro negro.
Comienza la baja por embarazo de Scully y Doggett tiene una nueva y poco experimentada compañera llamada Leyla Harrison. El entusiasmo incial de la joven desaparecerá cuando se enfrente a su primer caso y Mulder y Scully tendrán que acudir en su ayuda.
Mulder y Doggett investiga el incendio de un laboratorio de genética donde fue asesiando uno de los doctores que investigaba la fertilización alienígena. Allí encuentran a Billy Miles, que ha sido cambiado por una réplica tras ser abducido y trata de hacer desaparecer las pruebas. Cuando descubren que una mujer que ayuda Scully forma parte de la conspiración, los agentes, con Monica Reyes y Alex Krycek, se ocupan de proteger Scully y a su bebé.
Mulder, Doggett y Skinner tratan de poner al descubierto la conspiración que los replicantes ocultan tras la fachada del FBI mientras Reyes y Scully se ocultan en una granja donde la agente dará a luz a su bebé.