Walter decide seguir con el negocio a pesar de todos los conflictos que conlleva. Además, se ve obligado a contratar los servicios de un abogado deshonesto, Saul Goodman, para ayudar al traficante Badger después que fuese arrestado por la policía. Combo, otro de los distribuidores, es asesinado por una banda rival. Mientras todo esto sucede, Jesse comienza una relación con Jane, una joven que se está recuperando de su adicción a las drogas, y Walt encuentra un nuevo socio llamado Gus. Al final de la temporada, la esposa de Walter comienza a sospechar sobre la segunda vida de su marido.